A capacitação e a formação assumem-se como áreas estratégicas da CNIS no trabalho de proximidade que desenvolve com as suas associadas. A capacitação das instituições, nomeadamente por via da formação, tem como objetivo dotá-las das competências e ferramentas necessárias ao desenvolvimento de um trabalho de excelência no serviço que prestam aos seus utentes e no processo de crescimento que se pretende consolidar para o setor social e solidário.
Nesta linha, a CNIS apostou na sua própria certificação enquanto entidade formadora, o que lhe permite desenvolver, continuamente, respostas adequadas aos problemas e necessidades sentidos pelas instituições.